Action

Lagopède Alpin – Approche génétique pour actualiser les connaissances des paramètres démographiques.

Objectif

Les FDC de l’Isère, de la Savoie et de la Haute-Savoie ont pu débuter en 2020 les prospections pour recueillir des fèces de lagopèdes : elles contiennent des cellules épithéliales qui permettent d’identifier les individus grâce à des analyses génétiques confiées au laboratoire Antagène. Cette méthode innovante, non invasive et peu dérangeante, vise à comparer, sur les sites suivis par comparaison avec les suivis habituels, de réévaluer plusieurs paramètres biologiques : sex-ratio, taux de survie (CMR), densité de population.

Les trois années de suivi ont permis d’obtenir des résultats intéressants :
Les trois sites d’étude prospectés appartiennent à trois régions bioclimatiques différentes (Préalpes du Nord (74), Alpes Internes du Nord Occidentales (73), Alpes Internes du Nord Orientales (38)) :

Le protocole consiste à :

• collecter des faeces de Lagopèdes entre le 15 mai et le 20 juin (trois répétitions) pendant trois années consécutives. Certains de ces sites sont par ailleurs suivis par comptage au chant dans le cadre des suivis coordonnés par l’Observatoire des Galliformes de Montagne.
• faire réaliser par un laboratoire génétique des analyses sur la base de marqueurs microsatellites : compléter la palette des amorces (Costanzi et al, 2018) et obtenir les résultats : identification des individus permettant d’estimer les effectifs présents (CMR), le sex-ratio, les taux de survie, les déplacements individuels, voire la filiation…

L’étude est arrivée au terme des trois ans de suivi prévus, et a apporté des enseignements très intéressants :

• Sur les 2183 échantillons récoltés au cours de l’étude, 1011 étaient exploitables (soit seulement 46%)
• Différentes stratégies d’échantillonnage ont été testées, avec des taux d’échantillons utilisables variés. Il faut privilégier la collecte de crottes fraiches, si possibles sur la neige.
• Les taux de recapture d’individus sont de l’ordre de 35% à 50%
• Les « domaines vitaux » sont de surface variable, et globalement les domaines vitaux des mâles sont plus étendus que ceux des femelles
• Le sex-ratio obtenu était déséquilibré en faveur des mâles sauf sur le site isérois : ce résultat est probablement dû en partie à un biais méthodologique (femelles au nid au moment des prospections donc moins détectées que les mâles)
• Les modèles de capture-marquage-recapture (CMR) à partir des données génétiques ont été appliqués : les résultats génétiques + CMR donnent des effectifs nettement supérieurs aux comptages classiques au chant, et proches de ceux donnés par la méthode du « distance sampling »
• La structuration génétique des résultats met en évidence 5 populations relativement distinctes les unes des autres. Les deux populations haut-savoyardes restent cependant connectées. A l’échelle globale il semble y avoir deux meta-populations : Préalpes du Nord et Alpes internes du Nord.